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次バージョンでは、[オプション] でキャプチャーデバイスの設定を追加する予定です。

[プライマリ サウンド キャプチャ ドライバ] というのが、システムの既定のデバイスを表しています。
システムの既定のデバイスというのは、[ツール]-[デバイス設定] で設定されているものです。
こちらも参考にして下さい。
　[URL]
[プライマリ サウンド キャプチャ ドライバ] 以外のものを指定すると、システム設定に関わらず、そのデバイスを使用するようになります。

再生デバイスも同様に対応することは可能ですが、需要があるかどうか不明なので今のところ未対応です。